羊源性成分探針法熒光定量PCR試劑盒通用原則:
1, 先選擇好探針,然后設(shè)計(jì)引物使其盡可能的靠近于探針。
2, 擴(kuò)增子的長度應(yīng)不超過400bp,理想的*能在100-150bp內(nèi),擴(kuò)增片斷約短,有效的擴(kuò)增反應(yīng)就越容易獲得。較短的擴(kuò)增片斷也容易保證分析的一致性
3, 保持GC含量在20%和80%之間,GC富含區(qū)容易產(chǎn)生非特異反應(yīng),從而會導(dǎo)致擴(kuò)增效率的降低,及在SG分析中非特異信號。
4, 為了保證效率和重復(fù)性,應(yīng)避免重復(fù)的核苷酸序列,尤其是G(不能有4個連續(xù)的G)
5, 將引物和探針互相進(jìn)行配對檢測,以避免二聚體和發(fā)卡結(jié)構(gòu)的形成。
b),探針設(shè)計(jì)指導(dǎo)
1,在設(shè)計(jì)引物之前設(shè)計(jì)探針
2,探針的Tm值應(yīng)在68-70℃之間,如果是目測探針,則要仔細(xì)審查GC富含區(qū)。
3,探針的5’端要避免有鳥an酸,5’G會有淬滅作用,即使被切割下來這種淬滅作用也還會存在
4,選擇C多于G的鏈作探針,G的含量多于C會降低反應(yīng)效率,這時就應(yīng)選擇配對的另一條鏈作為探針。
6, 探針應(yīng)盡可能的短,不要超過30個bp。
7, 檢測探針的DNA折疊和二級結(jié)構(gòu)。
小鼠神經(jīng)干細(xì)胞(EGFP標(biāo)記)
人腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞
人腦血管平滑肌細(xì)胞
人海馬神經(jīng)元
人少突膠質(zhì)細(xì)胞
人星形膠質(zhì)細(xì)胞
小鼠成纖維細(xì)胞(EGFP標(biāo)記)
mCF, 小鼠心臟成纖維細(xì)胞
MN-c, 小鼠皮質(zhì)神經(jīng)元
MN-h, 小鼠海馬神經(jīng)元
MSC, 小鼠雪旺細(xì)胞
MA, 小鼠星形膠質(zhì)細(xì)胞
MLF, 小鼠淋巴成纖維細(xì)胞
mRTEC, 小鼠腎小管上皮細(xì)胞
CSC, 小鼠心肌細(xì)胞
mEPC, 小鼠內(nèi)皮祖細(xì)胞-骨髓
MEF, 小鼠胚胎成纖維細(xì)胞
NSC,大鼠神經(jīng)干細(xì)胞
RN-h, 大鼠海馬趾神經(jīng)元
rEPC,大鼠內(nèi)皮祖細(xì)胞-骨髓
RN-c, 大鼠皮質(zhì)神經(jīng)元
RN-s, 大鼠紋狀體神經(jīng)元
RSC, 大鼠雪旺細(xì)胞
RA, 大鼠星形膠質(zhì)細(xì)胞
RLF, 大鼠淋巴成纖維細(xì)胞
rRTEC, 大鼠腎小管上皮細(xì)胞
rCSC, 大鼠心肌細(xì)胞
RDFs, 大鼠真皮成纖維細(xì)胞
RLFs, 大鼠肺成纖維細(xì)胞
rCF, 大鼠心臟成纖維細(xì)胞
MN-h, 小鼠海馬神經(jīng)元
MN-s, 小鼠紋狀體神經(jīng)元
mOPC, 小鼠少突膠質(zhì)前體細(xì)胞
MA, 小鼠星形膠質(zhì)細(xì)胞
MLF, 小鼠淋巴成纖維細(xì)胞
mRTEC, 小鼠腎小管上皮細(xì)胞
CSC, 小鼠心肌細(xì)胞
小鼠骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞(BMSCs)
MEF, 小鼠胚胎成纖維細(xì)胞